Oriundo de San Salvador de Jujuy, estudió y se graduó de Médico Veterinario y Doctor en Medicina Veterinaria en la Universidad de Buenos Aires (UBA), desarrolló sus actividades profesionales principalmente como Investigador y Directivo en el Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), en el área de Salud Animal a partir del año 1958).
Gracias a becas otorgadas por la Institución cursó estudios formales de Posgrado en Estados Unidos, obteniendo primero el titulo de Master of Sience (MsC) en la Universidad de Cornell (NY) y a posteriori el Doctorado (Ph.D) en la Universidad de California, Davis.
Ha publicado dos tesis de Doctorado y más de 140 trabajos de su especialidad en revistas del país y del exterior.
Fue galardonado con destacados premios, entre ellos, Medalla de Oro de la Academia Nacional de Agronomía y Veterinaria (ANAV-1996), a los 10 Jóvenes Sobresalientes (DJS-1996). Premio Bunge y Born de Veterinaria (1979). Premio Vilfrid-Baron (ANAV-1987).
Se especializó en Patología Comparada con amplia trayectoria en rumiantes como así también en Enfermedades del Sistema Nervioso Animal en el Instituto de Neuropatología de la Universidad de Munich (Alemania).
Trabajó durante 18 años en la Estación Experimental que el INTA posee en Balcarce en la Provincia de Buenos Aires, donde desarrolló una vasta y fecunda actividad de investigación como así también de docencia universitaria en la Facultad de Ciencias Agrarias de la Universidad de Mar del Plata ubicada en el predio del INTA Balcarce.
En el campo de la investigación e investigación diagnóstica hizo aportes concretos en lo referente al mejoramiento de la Sanidad y Producción Animal, siendo sus hallazgos aplicados tanto en el país como en el exterior, especialmente en lo relacionado con deficiencias minerales en el ganado (cobre), enfermedades de la nutrición (hipomagnesemia), Calcinosis Enzootica Bovina (Enteque Seco), Calcinosis Enzootica Bovina (Enteque Seco), y su relación con la Vitamina D, Leucoencefalomalacia Bovina, Nigropalidaencefalomalacia Equina, Herpes Virus Encefalitis y otras enfermedades de origen infeccioso, nutricional y tóxico.
Además ocupó cargos Directivos: Co-director de los Programas Internacionales Operativos entre el INTA y FAO y director organizador del Proyecto de Sanidad Animal INTA- PNUD para el NOA. Jefe de Departamento de Producción Animal de la EERA Balcarce y coordinador del Programa de Bovinos para Carne de la Regional Pampeana.
En el año 1976 mediante licencia institucional fue contratado por la Universidad Federal Rural de Rio de Janeiro, Brasil, como profesor titular de Patología para los cursos de posgrado en Medicina Veterinaria y miembro colegiado para la administración dé Cursos de Educación Superior .
A su regreso al país se radicó en Buenos Aires y fué designado por INTA para dirigir el Departamento de Patología Animal en el Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias (CICV) en Castelar.
Alli continuó sus trabajos de investigación y también colaborando con la docencia en cursos de entrenamiento de profesionales en Enfermedades Exóticas a nivel Regional (USA.IICA.INTA) y de posgrado en la Facultad de Ciencias Veterinarias de la UBA en el curso de Patología para la Maestría de Ciencias Veterinarias de la FCV-UBA, en el área de Neuropatología. Asimismo coordino el Programa Nacional de Desarrollo de Unidades Regionales de Investigación en Sanidad Animal (URISAS).
Desde 1982 por concurso y hasta 1996 fue director del ClCVdel !NTA, Castelar, para posteriormente acogerse a su jubilación.
En su larga trayectoria profesional fue asimismo consultor de organismos internacionales tales como PNUD, FAO, IlCA y a nivel nacional fundador y primer presidente de la Asociación Argentina de Veterinarios de Laboratorios de Diagnostico y presidente de esa Asociación a nivel mundial (WAVLD) y miembro actual de la misma. Miembro de la comisión directiva de la Sociedad de Medicina Veterinaria y director y vocal en temas de Salud Animal. Miembro del Comité Científico de INPPAZ-OPS. Asesor de Revistas Científica entre otras de OIE y de la Sociedad de Medicina Veterinaria.
Finalmente y por la importancia sanitaria y económica que tiene para el país su condición de libre de “vaca loca”, cabe destacar que el Doctor Bernardo Carrillo desde 1990 integro el Comité Científico Asesor de la Argentina para las Encefalopatías Espongiforme Transmisibles (ET) e Investigador Asociado del Laboratorio de Referencia Regional de la OIE en el INIA en Castelar como así también la responsabilidad del Programa de Vigilancia de las EET para la República Argentina.